Mga produkto

Ang mga pathogenic molecular pathway sa mga cirrhotic liver disease tulad ng hepatitis C virus (HCV), autoimmune hepatitis (AIH) at primary biliary cirrhosis (PBC) ay hindi maganda ang katangian.Ang magkakaibang ipinahayag na mga gene ay kadalasang mahalaga sa pathogenesis ng sakit.Ang suppression subtractive hybridization (SSH) ay isang genome-wide approach na nagpapayaman para sa differentially expressed mRNA transcripts.Nilalayon naming gumawa ng mga nobelang obserbasyon ng differential gene expression sa cirrhosis gamit ang SSH na sinamahan ng quantitative real-time na reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR).Sinuri ng SSH ang mga transcriptome ng atay sa HCV cirrhosis, AIH cirrhosis, PBC, at nondisseased liver tissue.Ang mga nagresultang pantulong na DNA (cDNA) na mga clone ay na-rescreen para sa differential expression sa pamamagitan ng dot-blot hybridization at pagkatapos ay na-sequence.Ang mga napiling expression ng gene ay binibilang ng real-time na RT-PCR.Kasunod ng SSH, 694 na mga clone ang na-rescreen para sa differential gene expression, kung saan 145 ang nasunod-sunod at natagpuang nagmula sa 89 na magkakaibang mga gene.Ang pitong mga clone ay homologous lamang sa ipinahayag na sequence tag (EST) na mga pagkakasunud-sunod na pag-encode ng mga gene na walang alam na function.Ang up-regulated expression ng apat na genes ay nakumpirma ng real-time na RT-PCR: transmembrane 4 superfamily member 3 (tetraspanin CO-029) sa lahat ng anyo ng cirrhosis, hedgehog interacting protein (HIP) sa AIH cirrhosis at chitinase 3-like-1 (HC gp-39 o ykl-40) at arginine-glutamic acid repeat (RERE) sa HCV cirrhosis.Ang mga RERE gene polymorphism at mga variant ng splice ay na-obserbahan sa lahat ng mga tisyu na napagmasdan.Ang Tetraspanin CO-029 up-regulation ay pangunahing na-localize sa bile ductular cells.Sa konklusyon, ang mga obserbasyon ng nobela ng differential gene expression sa human cirrhosis ay ginawa gamit ang SSH bilang pangunahing tool sa pagtuklas.Sa partikular, ang mga karagdagang pag-aaral ng RERE gene at ang mga produkto nito sa HCV na nauugnay sa sakit sa atay ay kinakailangan.