Mga produkto

Mga mekanikal na insight sa isang pamilya na umaasa sa Ca2+ ng mga alpha-mannosidases sa isang gat symbiont ng tao.

Ang colonic bacteria, na ipinakita ng Bacteroides thetaiotaomicron, ay gumaganap ng isang mahalagang papel sa pagpapanatili ng kalusugan ng tao sa pamamagitan ng paggamit ng malalaking pamilya ng glycoside hydrolases (GHs) upang samantalahin ang mga dietary polysaccharides at host glycans bilang mga nutrients.Ang nasabing pagpapalawak ng pamilya ng GH ay ipinakita ng 23 pamilyang GH92 glycosidases na naka-encode ng B. thetaiotaomicron genome.Dito ipinapakita namin na ang mga ito ay mga alpha-mannosidases na kumikilos sa pamamagitan ng iisang mekanismo ng pag-alis upang magamit ang host N-glycans.Ang tatlong-dimensional na istraktura ng dalawang GH92 mannosidases ay tumutukoy sa isang pamilya ng dalawang-domain na protina kung saan ang catalytic center ay matatagpuan sa interface ng domain, na nagbibigay ng acid (glutamate) at base (aspartate) na tulong sa hydrolysis sa isang Ca(2+)- umaasa na paraan.Ang mga three-dimensional na istruktura ng GH92s sa complex na may mga inhibitor ay nagbibigay ng insight sa specificity, mekanismo at conformational itinerary ng catalysis.Ang Ca(2+) ay gumaganap ng isang pangunahing catalytic na papel sa pagtulong na i-distort ang mannoside mula sa ground-state nito (4)C(1) conformation ng upuan patungo sa transition state.（Bibliography: Nat.Chem.Biol.6, 125-32, (2010)

Frontal affinity chromatography ng ovalbumin glycoasparagines sa isang concanavalin A-sepharose column.Isang quantitative na pag-aaral ng binding specificity ng lectin.

Ang mga pakikipag-ugnayan ng Sepharose 4B-immobilized concanavalin A (ConA) na may 10 glycoasparagines na nagmula sa ovalbumin ay sinisiyasat sa dami ng frontal affinity chromatography.Sa pamamaraang ito, ang isang solusyon sa carbohydrate ay patuloy na inilalapat sa isang ConA-Sepharose column at ang pag-retard ng elution front ay sinusukat bilang isang parameter ng lakas ng pakikipag-ugnayan.Maaaring matukoy ang dissociation constant (Kd) para sa bawat saccharide na may ConA.Ang isang pagsusuri sa pagbubuklod ng p-nitrophenyl-alpha, D-mannoside ay nagpakita na ang mga nagbubuklod na katangian ng ConA ay hindi nagbabago ng mahalagang pagkatapos ng immobilization sa Sepharose 4B.Ang bawat isa sa mga ovalbumin glycoasparagines ay may label na tritium sa pamamagitan ng reductive methylation method para sa pagsusuri.Ang isang paghahambing ng mga halaga ng Kd na nakuha ay nagpakita na ang pagbubuklod ng ConA ay nag-iiba nang malaki sa napakaliit na pagkakaiba-iba ng istruktura ng glycosyl chain.Iminumungkahi ng mga resulta na kinikilala ng ConA ang isang partikular na istraktura ng glycosyl chain, Man alpha 1-6(Man alpha 1-3)Man, kung saan dapat na libre ang kahit isang hydroxyl group sa posisyon ng C-3 ng C-6-linked mannose.