Mga produkto

Ang mga kristal na istruktura ng carboxypeptidase T (CpT) complex na may phenylalanine at arginine substrate analogs - benzylsuccinic acid at (2-guanidinoethylmercapto)succinic acid - ay tinutukoy ng molecular replacement method sa mga resolusyon na 1.57 Å at 1.62 Å upang linawin ang malawak na profile ng substrate. ng enzyme.Ang mga konserbatibong nalalabi na Leu211 at Leu254 (naroroon din sa parehong carboxypeptidase A at carboxypeptidase B) ay ipinakita bilang mga determinant ng istruktura para sa pagkilala sa mga hydrophobic substrates, samantalang ang Asp263 ay para sa pagkilala sa mga positibong sisingilin na mga substrate.Binabago ng mga mutasyon ng mga determinant na ito ang substrate profile: ang CpT variant na Leu211Gln ay nakakakuha ng carboxypeptidase B-like properties, at ang CpT variant na Asp263Asn ang carboxypeptidase A-like selectivity.Ang Pro248-Asp258 loop na nakikipag-ugnayan sa Leu254 at Tyr255 ay ipinakita na responsable para sa pagkilala sa nalalabi ng C-terminal ng substrate.Ang substrate na nagbubuklod sa S1' subsite ay humahantong sa ligand-dep endent shift ng loop na ito, at ang Leu254 side chain na paggalaw ay naghihikayat sa pagbabago ng conformation ng Glu277 na nalalabi na mahalaga para sa catalysis.Ito ay isang nobelang pananaw sa pagpili ng substrate ng metallocarboxypeptidases na nagpapakita ng kahalagahan ng mga pakikipag-ugnayan sa pagitan ng subsite ng S1 at ng catalytic center.